韓国KRGDBデータの1722人サンプルにC1a1-M8 サンプル8人が発見された。古いbranchサンプル3人。
韓国KRGDBデータの1722人サンプルにC1a1-M8 サンプル8人が発見された。古いbranchサンプル3人。
M8 のSNP：M105 マッチング 8人
M8 のSNP：P121 マッチング 8人
M8 のSNP：P122マッチング 5人
M8 下位群のC-Y125471(本人branch)マッチング0人(33個のSNP全て検証、何のマッチングもなし)
M8 下位群のC-CTS9336 マッチングが 5人
M8/C-CTS9336/ 下位群C-CTS6678 マッチング 4人
M8/C-CTS9336/ 下位群C-Z1356 マッチング 0人
M8/C-CTS9336/C-CTS6678 の下位群C-Z7972 マッチング 4人
M8/C-CTS9336/C-CTS6678/C-Z7972 の下位群C-Y170131 マッチング 0人
検証経緯
①、以下のwebページを開く、英語を選択し、Genome Browserを押します。
http://coda.nih.go.kr/coda/KRGDB/index.jsp
②、「chrY」を選択し、右側の「Gene Information」と「KRG Variants (1722 individuals: Merged All)」をチェックする。（他の項目チェックしない）
③、yfullよりSNPのposition(HG19)を取得し、入力し、submitをする。
例：M8のSNP M105のposition(HG19)が 21866491
④、検索結果がある場合、KRG Common SNVs のデータをdownloadする。
⑤、出力したレコードの項目をチェックする。
例：M105のレコードのRefAlleleが C の場合、OKです。 （M105のpositionがOKの範囲は C toT、以外の場合、NG）
レコードがOKだったら、AltAlleleの値を計算する。 0.00486618 × 1722(総人数) ＝ 約８人
韓国のサンプル1722では8例のC1a1が認められ，割合0.46%と以前のSTR統計の割合0.5%が一致しており，韓国のC1a1は約0.5%の統計が現実に近いはずである。
